게놈 문장 | 생강 양식 연구 202 1 단량체 게놈

생강은 식용과 약용 이중 기능을 갖춘 진귀한 원예 작물이다. 그것은 한약의 중요한 성분일 뿐만 아니라 중요한 조미료이기도 하다. 그것은 중국에서 오랜 재배 역사를 가지고 있다. 중국 생강 재배 면적, 생산량, 수출량이 모두 세계 1 위를 차지했다. 장강 상류 생강 총면적은 226 만 묘로 전국의 49.7% 를 차지하며 시골 진흥을 추진하는 우선 산업이다. 생강은 숙근이 있고, 뿌리줄기는 육질이 풍만하며, 다양한 영양성분을 함유하고 있다. 단백질, 탄수화물, 비타민, 미네랄 외에도 생강페놀, 강유, 생강페놀 등 생체활성물질이 함유되어 있다. 조미료, 항암, 항진균, 항염, 항산화, 항혈소판 집결 등의 작용을 하여 향신료 가문과 약용 식물 가족의 중요한 구성원이다. 생강페놀은 생강 특유의 향미물질이자 생강의 다양한 기능활성성의 주요 기능요인으로 조미료 화장품 의료 등에 광범위하게 응용할 수 있는 전망을 가지고 있다. 생강은 세계에서 뚜렷한 경제적 가치를 가지고 있지만, 성번식난과 게놈이 크고 잡합성성이 높기 때문에 관련 분자생물학과 유전육종이 정체되어 있다. 또한 생강의 게놈 정보가 장기간 부족하여 합성 조절 메커니즘에 대한 우리의 인식이 제한되어 생강 분자 육종의 발전이 더디게 되었다.

최근 원예 연구는 두 가지 생강의 게놈 데이터를 온라인으로 연이어 발표했다. 평정산대와 베이징림대 식물유전육종 연구팀이' 생강 단배형 분석을 재배하는 게놈 조립과 등위유전자 특이적 유전자 표현' 이라는 제목의 연구논문이다. 충칭 문리학원이 서남대학과 합작한' 생강 (강공식) 단배형 분석 게놈과 독특한 강알코올 생합성 경로' 라는 연구 논문도 있다.

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평정산대 식물유전육종 연구팀 등 단위는 우리나라의 중요한 전통 생강 품종의 단배형 게놈 서열을 분석해 단배형 간의 차이를 밝혀내고 생강 고불육성의 게놈 기반을 추정해 생강페놀의 생합성경로를 초보적으로 천명했다. 후속 기능 연구와 분자 설계 육종을 위한 중요한 토대를 마련했다.

본 연구는 우리나라 최초로 농산물 지리 로고 등록 보호를 받은 생강 품종 장양강을 연구 대상으로 한다. 기록에 따르면' 장양강' 은 한나라부터 2000 여 년의 재배 역사를 가지고 있으며, 현재 하남 평정산시 루산현 장량진에 보존되어 있다. 이 품종은' 강중왕' 이라는 명성을 가지고 있으며, 빛깔이 짙은 노랑, 매운향, 향이 짙고, 실크가 짙고, 백요리가 썩지 않고, 오래도록 저장할 수 없는 우수한 특성을 가지고 있다.

본 연구는 선진적인 장독과 장시퀀싱 기술을 이용하여' 장양강' 의 단배형 게놈 서열을 분석했다. 두 가지 단배형 간의 유전적 차이를 검출해 생강 고배자 패육률과 관련된 구조적 변이 영역을 추정했다. 두 게놈 간의 등위 유전자 표현의 차이는 순식 조절 영역과 코딩 영역의 서열 차이, 트랜스포존의 근접 효과, 선택 압력과 관련이 있을 수 있음을 밝혀냈다. 유전자 * * * 표현 네트워크 분석을 바탕으로 생강페놀 생합성과 관련된 유전자 조절 메커니즘을 초보적으로 분석했다.

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충칭 문리학원 등 단위의 연구에 따르면 우리나라 서남지역 주종 죽근강의 게놈을 해독해 짧은 판독 길이 (369.5 1 Gb), 긴 판독 길이 PacBio(285.8 1 Gb),; 단일형의 게놈 크기는 각각 1.53 Gb (중첩 그룹 N50: 4.68 M) 와 1.5 1 GB (중첩 그룹 n50: 5.28) 입니다 등위 유전자 분석을 통해 두 개의 단배형 모두 총 55,635 개의 유전자 (모든 유전자의 72%) 가 동원성을 가지고 있다. 생강의 17226 개 대립유전자 중 1 1.9% 가 전사 수준에서 염색체 선호도를 나타냈다 (그림 2). 본 연구에 따르면 생강 게놈의 잡합도는 3.6% 로 현재 보도되고 있는 가장 높은 식물 게놈이다. 높은 반복수 중 긴 말단 반복수 (LTRs) 가 665,438 0.06% 를 차지하는 것은 게놈이 크고 잡합도가 높은 주요 원인일 수 있으며 생강 게놈 진화의 주요 원동력이기도 하다. 강등위 유전자는 두 개의 단배형에서 차이가 없고, 65438 개와 226 개의 등위 유전자 중 2055 개 (17+0.9%) 가 전사 수준에서 염색체 선호도를 나타냈다.

게놈, 전사조, 대사조학 데이터를 통합하여 생강 특유의 성분인 생강페놀의 합성 경로를 구축하고 12 개의 생강페놀 합성에 참여하는 주요 효소 가족 (PAL, C4h, 4Cl, CST, C3'H, CCOMT) 을 선별하고 감정했다.

저자 소개

생강 단배형 분석을 재배하는 게놈 조립과 대립유전자 특이표현.

평정산학원 부교수, 북림학원 지아 박사 (현재 산둥 농과학원에 취직), 유휘 박사, 장 (산둥) 유전기술유한공사 박사가 제 1 저자다. 통신원은 베이징 임업대학교 부교수 모검봉, 벨기에 겐특대 교수, 벨기에 왕립과학원원사인 이브 반더필이다. 평정산시 농업원 마애초 박사와 우종문 연구원도 연구에 참여했다. 이 직업에는 스웨덴 우메모 대학, 캐나다 라발 대학, 브리티시컬럼비아 대학, 겐트 대학, 프리토리아 대학, 난징 농업대학의 협력자도 포함된다. 본 연구는 허난성 과학기술공관, 평정산학원 고위층 인재 창업기금 등 프로젝트의 지지를 받았다.

이배체 생강의 단량체 분리 명명과 그 독특한 강매운 합성 경로.

이 일은 충칭 문리학원에서 이끌고, 장강대, 서남대, 화대 유전자가 공동으로 완성한다. 교수, 오림 부교수, 동조명부교수, 장교수, 장삼걸 박사는 논문 제 1 저자이고, 교수, 하청우 교수, 간검보 박사, 추용 부교수는 논문 통신작가이다. 제남시 제 2 농업과학원 연구원 리와 선임 엔지니어 이경지가 연구에 참가했다. 본 연구는 충칭 문리학원 생강 게놈 중대 프로젝트와 충칭시 자연과학기금의 지원을 받았다.

문장 링크:

생강 단배형 분석을 재배하는 게놈 조립과 대립유전자 특이표현.

/articles/S41438-021-00599-8

이배체 생강 단배형 분석 게놈과 독특한 생강페놀 생합성 경로.

/articles/S41438-021-00627-7